Jaarlijks wordt 30.000 ton mest en 30.000 ton OBA (Organisch Biologisch Afval) verwerkt bij Biofer. Het materiaal gaat naar een zeer grote voorvergistingstank waar het een soort voorvertering ondergaat. Typische bacteriën scheiden enzymen uit waardoor de grote organische molecules worden omgezet in kleinere oplosbare stoffen.
In dezelfde tank zijn er dan andere zuurvormende bacteriën die deze oplossen en verwerken tot laagmoleculaire organische zuren. Van hieruit gaat de voorvergiste stof naar 4 opeenvolgende vergistingtanks waar de methaanproductie gebeurd. Het aldus ontstane biogas wijkt af van aardgas door zijn methaangehalte (65 à 70%) en de aanwezigheid van een kleine hoeveelheid waterstofsulfide die verantwoordelijk is voor de geur. Het gas wordt dan opgevangen in een reservoir van waaruit het naar de WKK’s (Warmte kracht Koppelingen) wordt gestuurd die het omzetten in elektriciteit. De gemaakte stroom wordt via hoogspanningscabines omgezet in 10.000 Volt en van daaruit naar het stroomnetwerk gestuurd.
Het restmateriaal, digestaat genaamd, wordt via een ingenieus proces omgezet in een droog secundair afvalproduct die verkocht wordt aan derden waardoor Biofer zelf geen afval produceert.